病理科主要负责通过对人体组织、细胞、体液等生物样本进行形态学、免疫组织化学、分子生物学等多种技术手段的检查分析，以确定病变性质，明确疾病诊断，评估疾病预后，指导临床治疗。
病理科共有8名工作人员，其中诊断医生5人，病理技术员3人。开展了组织病理学检查、宫颈细胞学检查、非妇科细胞学检查、术中冰冻检查、免疫组化检查、特殊染色检查、EBV原位杂交检查、宫颈细胞DNA倍体检查等项目。
病理科已搬入新装修科室，位于2号楼7楼，面积约616平方米。拥有一批性能优质的医疗设备，包括奥林巴斯及蔡司的显微镜、莱卡的冰冻切片机及石蜡切片机，樱花的组织脱水机、染色机、封片机及盖片机，罗氏的免疫组化仪等，有利于制作优良的病理切片及病理诊断。