神经外科成立于1993年，是深圳市较早创建的神经外科之一，是以创伤神经外科、重症神经外科和脑血管病外科为特色的神经外科领域的临床治疗和科研机构，是区域性神经外科中心。
拥有先进的诊疗设备：西门子DSA设备、美敦力及蛇牌手术动力系统、德国齐柏林神经内镜、蔡司手术显微镜S700、进口SWJ90型新型多体位神经外科手术头架、德国西门子呼吸机、Drager呼吸机、Codman和SOPHYSA有创颅内压监护系统、无创脑水肿监测系统、多功能脑康复治疗仪、全自动半导体冰毯机等。
神经外科学科带头人是甄云主任医师，硕士研究生导师，发表学术论文二十余篇，获得市级科技成果奖2项，市级立项2项，区级立项3项。曾被评为宝安区“十佳医务工作者”。科室拥有医教研团队成员8人，其中主任医师2人、副主任医师4人、主治医师2人；硕导1人、硕士2人、本科5人。国外研学医师1人，科室医师均有国内知名医院学习进修经历。
重症神经外科
重症神经外科具有专业水准的神经重症监护病房，配备有专业呼吸机、冰毯等多种重症监护救治设备，设有床位5张。熟练掌握处理神经系统急危重症技术，例如因脑出血、大面积脑梗死、颅脑外伤、中枢神经系统感染等导致的意识障碍、呼吸衰竭、颅内高压等。已开展亚低温脑保护、颅内压监测、气管切开术等技术，实现多模态监测、生命支持、精准治疗等功能。
脑血管病外科
熟练掌握各类出血性脑血管疾病的救治。例如颅内动脉瘤、脑血管畸形、蛛网膜下腔出血、各部位高血压脑出血、小脑出血的开颅手术及微创穿刺手术治疗，DSA脑血管造影检查及动脉瘤微创神经介入栓塞术。
创伤神经外科
是区域性创伤神经外科救治中心，熟练掌握各种颅脑损伤的救治，重型颅脑损伤、脑挫裂伤、硬膜外血肿、硬膜下血肿、弥漫性轴索损伤的救治，以及头皮裂伤、头皮撕脱伤、颅骨骨折、颅底骨折的救治，颅骨缺损修补手术治疗。
颅内肿瘤及功能神经外科
开展包括脑膜瘤、胶质瘤、转移瘤、垂体瘤等颅内外肿瘤的手术治疗，开展面肌痉挛、三叉神经痛的手术治疗、植物人促醒等技术。