消化内科设有门诊、病房、消化内镜中心三部分。消化内镜中心位于综合楼12楼。
科室现有医生13人，其中主任医师1人，副主任医师7人，主治医师4人，住院医师1人。其中全日制博士1人，硕士8人。曾与全国消化科专科排名第一的上海交通大学医学院附属仁济医院和中山大学二院消化科合作数年。深圳大学黄思霖教授为目前医院特聘消化内科教授。常规开展内镜下治疗性操作及四级手术。
诊治项目：
主要诊治食管、胃肠道、肝胆、胰腺等相关疾病。包括消化道出血、消化性溃疡、急性胰腺炎（AP）、功能性胃肠病（FD）、炎症性肠病（IBD）、肝炎肝硬化及并发症、胆囊炎、胆石症以及各种消化系统疑难疾病。
消化内镜中心常规开展各种内镜微创手术：标准的消化道（食管胃结肠）癌前病变及早癌的精筛检查及治疗（ESD）；内镜下食管胃底静脉曲张精准断流术（ESVD）；消化道息肉切除术（包括EMR）；食道癌支架安置术；各种消化道异物取出术；经口内镜下肌切开术（POEM）治疗贲门失弛缓症；经十二指肠镜治疗胆管结石、胆管癌等（ERCP相关技术）；超声内镜EUS及EUS-FNA等诊治胰腺相关疾病。
科室特色：
1.宝安区中心医院全专协同、深圳基层医疗集团特色的消化道肿瘤筛查中心（GICC）；
2.胃肠镜预约力争全市领先，内镜预约中心可满足点名检查；
3.周末坚持常规无痛胃肠镜诊疗近10年，常年接受团体胃肠镜预约VIP体检服务；
4.炎症性肠病患者的IBD-MDT诊治模式，日间输注中心（一院两地）。